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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
11/11/2022 |
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Data da última atualização: |
11/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Nota Técnica/Nota Científica |
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Autoria: |
AZEVEDO, A. L. S.; SOUZA, F. R. de; CAMPOS, R. A.; REIS, D. R. de L.; MACHADO, J. C.; MACHADO, M. A.; LEDO, F. J. da S.; RESENDE, M. |
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Afiliação: |
ANA LUISA SOUSA AZEVEDO, CNPGL; FLÁVIA RANGEL DE SOUZA; ROSIANA ANGÉLICA CAMPOS; DANIELE RIBEIRO DE LIMA REIS FAZA, CNPGL; JUAREZ CAMPOLINA MACHADO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; FRANCISCO JOSE DA SILVA LEDO, CNPGL; MARCIO RESENDE, University of Florida. |
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Título: |
Development of microsatellite panels for molecular fingerprinting of Napier grass (Cenchrus purpureus) cultivars. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 22, n. 4, e42522244, 2022. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Nota científica. |
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Conteúdo: |
Napier grass is a perennial tropical forage that is used in beef and dairy production systems. Despite its significance in animal nutrition, molecular information available, such as microsatellite or simple sequence repeat (SSR) or single nucleotide polymorphism (SNP) markers, is limited. Using an assembled transcriptome, 50 novel SSR markers were developed, of which 21 were found to be polymorphic. These polymorphic markers were tested for DNA fingerprinting of Embrapa cultivars, five of which revealed distinct allele patterns for cultivar identification. SSR markers 05, 17, and 44 identified a unique pattern in the BRS Kurumi cultivar. The BRS Capiaçu cultivar was identified using SSR markers 17, 43, and 44. The Pioneiro cultivar exhibited a rare fragment amplification pattern using SSR marker 46, while SSR marker 44 revealed a distinct allele in the BRS Canará cultivar. SSR marker panels could be utilized as DNA fingerprinting tools to assist in cultivar identification. |
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Palavras-Chave: |
Breeding program; Elephant grass; SSR. |
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Thesagro: |
Capim Elefante; Grama. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1148220/1/Development-of-microsatellite-panels-for-molecular-fingerprinting-of-Napier-grass.pdf
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Marc: |
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520 $aNapier grass is a perennial tropical forage that is used in beef and dairy production systems. Despite its significance in animal nutrition, molecular information available, such as microsatellite or simple sequence repeat (SSR) or single nucleotide polymorphism (SNP) markers, is limited. Using an assembled transcriptome, 50 novel SSR markers were developed, of which 21 were found to be polymorphic. These polymorphic markers were tested for DNA fingerprinting of Embrapa cultivars, five of which revealed distinct allele patterns for cultivar identification. SSR markers 05, 17, and 44 identified a unique pattern in the BRS Kurumi cultivar. The BRS Capiaçu cultivar was identified using SSR markers 17, 43, and 44. The Pioneiro cultivar exhibited a rare fragment amplification pattern using SSR marker 46, while SSR marker 44 revealed a distinct allele in the BRS Canará cultivar. SSR marker panels could be utilized as DNA fingerprinting tools to assist in cultivar identification.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| 2. |  | FRANCO, A. L.; TAGLIATTE, M. A.; AZEVEDO, A. L. S.; CAMPOS, R. A.; SOUZA, F. R. de; PEREIRA, A. V.; VICCINI, L. F. Transferability of microsatellite markers (SSR) from Setaria italica to Setaria sphacelata (Poaceae). In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66., 2021. E-Book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2021. p. 469.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | ALVES, A. S.; CAMPOS, R. A.; MALUF, V. H. H. K.; PEREIRA, H. P.; VIEIRA, F. de O.; REIS, D. R. de L.; GUIMARÃES, A. S.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F. Identificação de vacas da raça Holandesa portadoras de alelo recessivo das doenças genéticas CVM, BLAD e DUMPS e genotipagem para Beta-caseína. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 25., 2021, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 261).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | AZEVEDO, A. L. S.; SOUZA, F. R. de; CAMPOS, R. A.; REIS, D. R. de L.; MACHADO, J. C.; MACHADO, M. A.; LEDO, F. J. da S.; RESENDE, M. Development of microsatellite panels for molecular fingerprinting of Napier grass (Cenchrus purpureus) cultivars. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 22, n. 4, e42522244, 2022. Nota científica.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | SOARES, I. K. de A.; CUNHA FILHO, J. A. da; SOARES, G. O.; LIMA, T. R. de; MALUF, V. H. H. K.; CAMPOS, R. A.; LOURES, C. de O.; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; REIS, D. R. de L.; CAMPOS, M. M.; PEREIRA, H. P.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, W. A. Otimização de metodologia para isolamento de leucócitos a partir de sangue total periférico de bovinos. In: PASSOS, L. P. (ed.). Coletânea de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite-PIBIC CNPq 2020-2021. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 262).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | LIMA, T. R. de; MALUF, V. H. H. K.; CAMPOS, R. A.; SOARES, I. K. de A.; PEREIRA, H. P.; DOMINGUES, R.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Pesquisa do alelo B de beta-caseína em touros da raça Girolando por tetraprimer ARMS-PCR1. In: PASSOS, L. P. (ed.). Coletânea de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite-PIBIC CNPq 2020-2021. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 262).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | MALUF, V. H. H. K.; LIMA, T. R. de; CAMPOS, R. A.; SOARES, I. K. de A.; PEREIRA, H. P.; DOMINGUES, R.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Desenvolvimento de teste de genotipagem em bovinos para o SNP A1/A2 do gene da beta caseína, usando a técnica de tetra-primer ARMS-PCR. In: PASSOS, L. P. (ed.). Coletânea de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite-PIBIC CNPq 2020-2021. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2021. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 262).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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